随着产前亲子鉴定技术和理论的日益成熟，胎儿亲子鉴定可以在保证母子安全的同时进行。胎儿亲子鉴定有两个时间段。一般孕妇怀孕14周后可以用羊水进行亲子鉴定。

　　无创亲子鉴定和胎儿亲子鉴定最大的区别是无创亲子鉴定不需要羊水穿刺，只需要从孕妇那里抽取静脉血，所以比较安全，但是无创亲子鉴定的成本比较高，鉴定结果10-15天，最早7天。无创亲子鉴定的最佳时间与胎儿亲子鉴定相似。

　　羊水的采集过程由专业妇产科医生在可视b超的监测下进行。如果孕妇小腹穿刺，从孕妇腹部取出，取出的绒毛或羊水中肯定会有孕妇自身的组织和血液，也就是说绒毛和羊水中会含有少量的孕妇DNA。因此，为了保证鉴定结果的准确性，必须添加母亲样本进行检测，然后与胎儿DNA进行比较，以确认从绒毛或羊水中提取的DNA是真正的胎儿DNA，而不是孕妇自己的DNA，从而消除出错的可能性，提高胎儿亲子鉴定的准确性。

　　胎儿亲子鉴定一般由三个人一起鉴定。胎儿亲子鉴定的准确率实际上是父母鉴定的准确率。一般25位点的单亲准确率可以达到99.999%。父母呢?一般可达99.999%，比单亲鉴定高一个数量级。因此胎儿亲子鉴定，其实质是双亲亲子鉴定，只是胎儿样本比较特殊而已。